Please use this identifier to cite or link to this item:
http://kb.psu.ac.th/psukb/handle/2016/17947
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.advisor | Ponsit Sathapondecha | - |
dc.contributor.author | Manita Nonsung | - |
dc.date.accessioned | 2023-04-07T07:21:02Z | - |
dc.date.available | 2023-04-07T07:21:02Z | - |
dc.date.issued | 2021 | - |
dc.identifier.uri | http://kb.psu.ac.th/psukb/handle/2016/17947 | - |
dc.description | Master of Science in Molecular Biology and Bioinformatics (International Program), 2021 | en_US |
dc.description.abstract | One of several molecular factors control ovarian development in organisms is receptors which play an initial role in signaling pathways in several physiological processes, including reproduction. This study aimed to identify the potential receptors involved in the control of female banana shrimp, Fenneropenaeus merguiensis, reproduction. The ovarian transcriptome derived from 4 developmental stages was constructed from Illumina RNA sequencing and bioinformatics analysis. A total of 53,763 transcripts was de novo assembled, and 663 genes were identified as receptors. Among them, 1 8 5 receptors were differentially expressed during ovarian development. The 15 differentially expressed receptor genes related to ovarian maturation were selected to validate for their expressions by qRT- PCR. In this study bone morphogenetic protein receptors (BMPR) were further characterized and studied their function in shrimp. Both saxophone (FmSax), a BMPR type I, and FmBMPR type II (FmBMPRII) were mainly expressed in eyestalks. The mRNA expression of FmSax was increased at the mature stage whilst expression of FmBMPRII was high at the late vitellogenic stage in both ovary and hepatopancreas. To study the role of FmSax, the double-stranded RNA specific to FmSax (dsSax) was produced in Escherichia coli. On day 7 after the injection of dsSax to female F. merguiensis shrimps, FmSax expression was significantly suppressed, and vitellogenin (Vg) and FmBMPRII expressions were significantly increased in both ovary and hepatopancreas. In addition, the knockdown of FmSax led to induce oocyte proliferation in vivo. These suggested that FmSax positively controls Vg synthesis, but negatively regulates oocyte proliferation in shrimp. | en_US |
dc.description.sponsorship | PSU (Grant No. SCI6202049a) and the Science Achievement Scholarship of Thailand. | en_US |
dc.language.iso | en | en_US |
dc.publisher | Prince of Songkla University | en_US |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Thailand | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/th/ | * |
dc.subject | Vitellogenesis | en_US |
dc.subject | Banana Shrimp | en_US |
dc.subject | Molecular biology | en_US |
dc.title | Identification and Functional Study of Potential Receptors Involved in Vitellogenesis of Female Banana Shrimp Fenneropenaeus merguiensis | en_US |
dc.title.alternative | การระบุและศึกษาหน้าที่ของยีนรีเซพเตอร์ที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการพัฒนารังไข่ในแม่กุ้งแชบ๊วย | en_US |
dc.type | Thesis | en_US |
dc.contributor.department | Faculty of Science (Molecular Biotechnology and Bioinformatics) | - |
dc.contributor.department | คณะวิทยาศาสตร์ สาขาวิชาชีววิทยาโมเลกุลและชีวสารสนเทศ | - |
dc.description.abstract-th | ยีนตัวรับสัญญาณเป็นหนึ่งในปัจจัยสำคัญที่มีบทบาทแรกเริ่มโดยการส่งสัญญาณต่าง ๆ ที่เกี่ยวกับการควบคุมกระบวนการทางสรีระร่างกายที่สำคัญ เช่น กระบวนการสืบพันธุ์ ในสิ่งมีชีวิต ใน งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์ที่จะระบุและศึกษาบทบาทหน้าที่ของยีนตัวรับสัญญาณที่เกี่ยวข้อง ต่อ กระบวนการพัฒนารังไข่ในแม่กุ้งแชบ๊วยโดยอาศัยการวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอจำนวนมากด้วย Illumina RNA sequencing และการวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศ ผลการศึกษาพบว่าสามารถสร้าง ทรานสคริปโตมจากรังไข่กุ้งแชบ๊วยเพศเมียในแต่ละระยะการพัฒนารังไข่ได้ยีนทั้งหมด 53,763 ยีน โดย ระบุเป็นยีนตัวรับสัญญาณจำนวน 663 ยีน การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในแต่ละระยะการพัฒนารัง ไข่พบว่ายีนตัวรับสัญญาณจำนวน 185 ยีน จากยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน ในการศึกษานี้ตัวรับสัญญาณ จำนวน 15 ยีน ที่มีการแสดงออกแตกต่างในระยะการพัฒนารังไข่ และเกี่ยวข้องกับกระบวนการพัฒนา ระบบสืบพันธุ์ ได้ถูกเลือกมาเพื่อศึกษาการแสดงออก ด้วยวิธี qRT-PCR นอกจากนี้ได้ทำการเลือก bone morphogenetic protein receptor ประเภท 1 (BMPRI) หรือ saxophone (FmSax) และ BMPR ประเภท 2 (FmBMPRII) ในการศึกษาบทบาทหน้าที่ต่อกระบวนการพัฒนารังไข่ พบว่า ทั้งยีนตัวรับ FmSax and FmBMPRII ต่างก็มีการแสดงออกสูงในก้านตา เมื่อเทียบกับเนื้อเยื่อ อื่น ๆ เมื่อศึกษาการ แสดงออกในรังไข่และตับ พบว่ายีนตัวรับ FmSax มีการแสดงออกสูงระยะไข่สุกในขณะที่ FmBMPRII มี การแสดงออกสูงระยะกำลังพัฒนา ในการศึกษาหน้าที่ของยีนในระบบสืบพันธุ์อาศัยเทคนิค RNA interference โดยสามารถผลิตอาร์เอ็นเอสายคู่ที่จำเพาะต่อยีน FmSax (dsSax) จากแบคทีเรีย VI Escherichia coli โดยหลังจากฉีด dsSax เข้าไปในกุ้งแชบ๊วยเพศเมียไป 7 วัน พบว่า การแสดงออกของ FmSax ลดลงอย่างมีนัยสำคัญ และยังส่งผลให้การแสดงออกของยีนไวทิลโลจินิน (FmVg) และ FmBMPRII ลดลงทั้งในรังไข่และตับด้วย แต่หากการยับยั้งการแสดงออกของ FmSax กลับเพิ่มระดับการ เจริญของเซลล์ไข่ ชี้ให้เห็นว่า FmSax มีบทบาทหน้าที่ควบคุมการแสดงออกของยีนไข่แดง และการเจริญ ของเซลล์ไข่ | en_US |
Appears in Collections: | 348 Thesis |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
6110220077.pdf | 8.15 MB | Adobe PDF | View/Open |
This item is licensed under a Creative Commons License